Lắng đọng và tách biệt bùn đỏ là một quá trình vật lý và hóa học cực kỳ phức tạp. Quy trình Bayer hòa tan bột giấy là một huyền phù được hình thành bởi bùn đỏ và dung dịch natri aluminate. Do các tương tác vật lý và hóa học phức tạp giữa các hạt bùn đỏ và dung dịch, thành phần pha, phân bố, hình thái bề mặt của các hạt bùn đỏ, hàm lượng rắn của huyền phù bùn đỏ, thành phần pha lỏng, nhiệt độ huyền phù bùn đỏ, v.v. đều có ảnh hưởng đáng kể đến quá trình lắng đọng và tách biệt huyền phù bùn đỏ.

Bằng cách thêm flocculant cụ thể có thể tăng tốc độ lắng của quá trình tách rắn-lỏng một cách đáng kể. Cơ chế của các flocculant cao phân tử nằm ở sự đông tụ hiệu quả giữa các hạt bùn đỏ thông qua cầu hấp phụ, hấp phụ bề mặt và trung hòa điện tích, và sự hình thành "các hạt lớn", điều này làm tăng tốc độ lắng một cách đáng kể. Các dung dịch khác nhau có bột giấy có các tính chất khác nhau, và các flocculant polymer phù hợp phải được chọn thông qua các thí nghiệm trước khi đạt được sự tách biệt hiệu quả cao của bùn đỏ tại chỗ.